- s -

• Score : TemplateResidue
• score_extra : ProspectThreadingInfo
• score_mask : z_loop_calc_data
• score_matrix : DynamicAlign
• scores : ProspectThreadingInfo
• second_guess : ProspectParam
• simple_twobody : ProspectParam
• single_del : TargetResidue
• single_ins : TargetResidue
• single_score : RotamerMask
• SINGLETON : ProspectParam
• size_x : DynamicAlign
• size_y : DynamicAlign
• sort_val : ProspectOutput
• source_matrix : DynamicAlign
• sources : UT
• SS : TargetResidue
• SS_PROB : TargetResidue
• start_icode : TemplateStruct
• start_res : TemplateStruct
• state : RotamerMask
• state_count : td_graph
• step_size : z_loop_calc_data
• step_start : z_loop_calc_data
• stop_icode : TemplateStruct
• stop_res : TemplateStruct
• structure : RotamerMask, TargetStruct, ResidueInfoElement
• StVec : ArcBall_t
• SW : Matrix4f_t
• SX : Matrix4f_t, Matrix3f_t
• SY : Matrix4f_t, Matrix3f_t
• SZ : Matrix4f_t, Matrix3f_t

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