- a -

• AA1toAA3() : open_prospect.h
• AA1toAANum() : open_prospect.h
• AA3toAA1() : open_prospect.h
• AANumtoAA1() : open_prospect.h

- c -

• calc_contact_frozen() : open_prospect.h
• calc_contactdel() : open_prospect.h
• calc_coredel() : open_prospect.h
• calc_del_val() : open_prospect.h
• calc_dfire() : open_prospect.h
• calc_distconst() : open_prospect.h
• calc_ins_val() : open_prospect.h
• calc_LRET() : open_prospect.h
• calc_mutation() : open_prospect.h
• calc_mutationfull() : open_prospect.h
• calc_mutationlog() : open_prospect.h
• calc_mutscore() : open_prospect.h
• calc_pair_energy() : open_prospect.h
• calc_raw_score() : open_prospect.h
• calc_sec_struct() : open_prospect.h
• calc_single_energy() : open_prospect.h
• calc_singledel() : open_prospect.h
• calc_singleins() : open_prospect.h
• calc_singleton() : open_prospect.h
• calc_twobody() : open_prospect.h
• calc_twobody_frozen() : open_prospect.h
• calc_twobody_val() : open_prospect.h

- p -

• PDBAtomtoNum() : open_prospect.h
• Prospect_RotamerMask_DEE() : open_prospect.h
• Prospect_RotamerMask_DEE_Split() : open_prospect.h
• Prospect_RotamerMask_TreeDecomp() : open_prospect.h
• Prospect_Target_Rotamer() : open_prospect.h
• Prospect_Target_RotamerMask_Free() : open_prospect.h
• Prospect_Target_RotamerMask_Init() : open_prospect.h

- r -

• ResidueAtoms_CalcCb() : open_prospect.h
• rot_mask_pairscore_get() : open_prospect.h
• rot_mask_pairscore_set() : open_prospect.h

- s -

• shuffle_seq() : open_prospect.h
• smAdd() : sm_matrix.h
• smCalcFrobeniusNorm() : sm_matrix.h
• smCalcInterRmsd() : sm_matrix.h
• smCalcMeanOrigin() : sm_matrix.h
• smCalcMinRmsdRotation() : sm_matrix.h
• smCalcMinRmsdRotationTri() : sm_matrix.h
• smCalcRmsd() : sm_matrix.h
• smComputeConvertMatrix() : sm_matrix.h
• smCopy() : sm_matrix.h
• smCrossProduct() : sm_matrix.h
• smDistance() : sm_matrix.h
• smDotProduct() : sm_matrix.h
• smInverseMatrix() : sm_matrix.h
• smMakeRotationMatrix() : sm_matrix.h
• smMinus() : sm_matrix.h
• smMoveMeanOrigin() : sm_matrix.h
• smMoveMinRmsd() : sm_matrix.h
• smMultMat() : sm_matrix.h
• smMultVec() : sm_matrix.h
• smNorm() : sm_matrix.h
• smNormalize() : sm_matrix.h
• smSub() : sm_matrix.h
• smVectorAngle() : sm_matrix.h
• smZero() : sm_matrix.h
• solvent_acc() : open_prospect.h
• solvent_sec_struct() : open_prospect.h
• SS1toSSNum() : open_prospect.h
• ss_filter() : open_prospect.h

---